El martes 15 de junio de 1621, se estaba aún construyendo la nueva Parroquia de Moratalla, obras que se iniciaron en 1561; en la Iglesia había un Cristo crucificado. Ese martes, los fieles asistentes a la Iglesia celebraban la octava del Santísimo Sacramento junto al párroco Alonso Vadillo. Entre los asistentes se encontraban Francisco de Ondoño y Justa García, que llevaban a bautizar un niño de Martín Sánchez y Luisa Martinez, el bautiza lo celebró Don Jerónimo Moreno, poniendo al niño el nombre de Pedro; y en la partida de bautismo, al margen de la misma, en el archivo de la parroquia, puede leerse "Este día y año sucedió el milagro del Santísimo Cristo del Rayo".

          Sobre las tres de la tarde, sonó la campana de la Iglesia, advirtiendo la cercanía de una nube, y en efecto, se desencadeno una nube torrencial, y la Iglesia comenzó a llenarse de fieles que venían en busca de refugio.. en ese escenario y en plena tormenta un rayo entró a la Iglesia que se detenía como si algo le impidiese continuar; como si una fuerza superior lo sujetase... cayó en torno a la imagen del Cristo, rodeándole y disipándose en humo.